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成分分析,配方還原,食品檢測,藥品檢測,化妝品檢測,環(huán)境檢測,性能檢測,耐熱性檢測,安全性能檢測,水質檢測,氣體檢測,工業(yè)問題診斷,未知成分分析,塑料檢測,橡膠檢測,金屬元素檢測,礦石檢測,有毒有害檢測,土壤檢測,msds報告編寫等。

成脂相關miRNA測序檢測

發(fā)布時間:2025-08-12

關鍵詞:成脂相關miRNA測序測試儀器,成脂相關miRNA測序測試機構,成脂相關miRNA測序測試周期

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來源:北京中科光析科學技術研究所

文章簡介:

成脂相關miRNA測序檢測專注于分析脂肪形成過程中microRNA的表達特征。該檢測采用高通量測序技術,識別與脂肪細胞分化、脂質代謝調控相關的miRNA分子。核心內(nèi)容包括樣本RNA提取、文庫構建、測序數(shù)據(jù)生成以及生物信息學處理,確保數(shù)據(jù)準確性和重復性。
點擊咨詢

因業(yè)務調整,部分個人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項目

miRNA提取效率檢測:評估生物樣本中微小RNA的分離效果;具體檢測參數(shù)包括濃度測定(ng/μl)、純度(A260/A280比值)、完整性指數(shù)(RIN值)。

高通量測序文庫構建:制備用于測序的cDNA文庫;具體檢測參數(shù)包括文庫大小(150-300 bp范圍)、濃度(nM單位)、接頭連接效率(%覆蓋率)。

測序深度與覆蓋度分析:確保序列數(shù)據(jù)的全面性;具體檢測參數(shù)包括reads數(shù)量(百萬級)、平均覆蓋倍數(shù)、目標區(qū)域覆蓋百分比。

miRNA表達定量:計算個體miRNA的表達水平;具體檢測參數(shù)如reads per million mapped reads (RPM)、標準化因子(TMM或DESeq2)。

差異表達分析:識別成脂相關miRNA的表達變化;具體檢測參數(shù)包括fold change閾值(≥2倍)、統(tǒng)計顯著性(p值<0.05)、錯誤發(fā)現(xiàn)率(FDR校正)。

靶基因預測:推斷miRNA的潛在作用目標;具體檢測參數(shù)使用算法評分閾值(如TargetScan context score >0.5)、結合位點保守性評估。

功能富集分析:揭示靶基因的生物學意義;具體檢測參數(shù)包括Gene Ontology富集分析(q值<0.1)、KEGG通路富集度(富集因子>1.5)。

定量PCR驗證:獨立確認測序結果可靠性;具體檢測參數(shù)如Ct值范圍、相對表達量計算(2^-ΔΔCt方法)。

樣本質量控制:評估輸入材料適用性;具體檢測參數(shù)包括RNA降解程度(28S/18S比值)、污染物檢測(DNA殘留率<5%)。

生物信息學流程評估:監(jiān)控數(shù)據(jù)處理質量;具體檢測參數(shù)包括比對率(>90%)、重復序列率(<20%)、錯誤率(<0.1%)。

序列變異檢測:篩查miRNA突變或編輯;具體檢測參數(shù)包括單核苷酸變異頻率閾值(≥5%)、編輯位點鑒定。

表達相關性分析:研究miRNA與成脂標志物關聯(lián);具體檢測參數(shù)如皮爾遜相關系數(shù)(絕對值>0.7)、聚類分析參數(shù)。

檢測范圍

脂肪組織活檢樣本:人類或動物模型的脂肪樣本,用于體內(nèi)脂肪形成機制研究。

脂肪細胞培養(yǎng)模型:體外誘導干細胞分化的脂肪細胞,模擬成脂過程。

血液循環(huán)樣本:全血或血清樣本,分析代謝疾病中的循環(huán)miRNA表達。

肥胖研究模型:遺傳性或飲食誘導肥胖動物的脂肪組織樣本。

糖尿病相關樣本:糖尿病動物模型或患者的胰腺及脂肪樣本。

營養(yǎng)干預實驗樣本:飲食調控后的細胞或組織樣本,研究營養(yǎng)因子影響。

藥物研發(fā)樣本:測試化合物對miRNA表達作用的細胞培養(yǎng)物。

干細胞分化樣本:多能干細胞定向分化為脂肪細胞的各階段材料。

基因編輯模型:CRISPR技術修飾的細胞或組織,探索基因功能。

臨床隊列樣本:大規(guī)模人群研究的脂肪或血液樣本,用于流行病學分析。

代謝器官交叉樣本:肝臟或肌肉組織,研究器官間調控網(wǎng)絡。

動物模型脂肪庫:小鼠、大鼠等常見模型的皮下或內(nèi)臟脂肪樣本。

檢測標準

ISO 20395:2019 生物技術-高通量測序的質量控制要求。

GB/T 33682-2017 高通量測序數(shù)據(jù)質量控制通用要求。

ISO/IEC 17025:2017 測試和校準實驗室能力的通用要求。

ASTM E2677-2014 基因表達譜分析的標準指南。

GB/T 30999-2014 人類生物樣本庫基本要求。

MIAME標準 基因表達數(shù)據(jù)報告最小信息規(guī)范。

MINSEQE標準 測序實驗最小信息報告準則。

EN ISO 15189:2012 醫(yī)學實驗室質量和能力要求。

檢測儀器

高通量測序平臺:用于生成miRNA序列數(shù)據(jù);在本檢測中執(zhí)行深度測序,產(chǎn)生原始reads文件。

核酸提取系統(tǒng):高效分離微小RNA分子;具體功能為從組織或細胞中純化高質量RNA。

文庫制備自動化工作站:構建測序文庫;功能包括RNA片段化、末端修復和接頭連接。

實時熒光定量PCR系統(tǒng):驗證特定miRNA表達水平;功能為測定Ct值并計算差異表達。

生物信息學分析服務器:處理大規(guī)模測序數(shù)據(jù);功能包括序列比對、表達定量和差異分析。

電泳裝置:評估RNA完整性;功能為檢測降解程度,確定樣本適用性。

冷凍離心設備:處理低溫敏感樣本;功能為分離樣本組分并維持穩(wěn)定性。

微量分光光度計:測量核酸濃度;功能為量化提取的miRNA濃度和純度。

檢測流程

1、咨詢:提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認檢測用途及項目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品,安排費用后進行樣品檢測

6、檢測出相關數(shù)據(jù),編寫報告草件,確認信息是否無誤

7、確認完畢后出具報告正式件

8、寄送報告原件

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